Фамилия Новоженко — яркий пример украинской модели фамилий на -енко, которую в ономастике называют «патронимической» или «сыновьей». Суффикс -енко исторически означал «маленький», «сын» или «потомок», то есть Новоженко — это буквально «сын Новоженого». Сама основа «Новожен-» восходит к прозвищу Новоженый, которое в старину давали недавно женившемуся мужчине. В говорах «новожён» или «новоженя» — молодожён, человек, только что вступивший в брак.

На первый взгляд, фамилия кажется прозрачной, но в ней есть тонкость. В отличие от более распространённых «свадебных» фамилий вроде Женихов или Молодожёнов, Новоженко почти не встречается в центральных и северных великорусских землях. Это типично южнорусская и украинская фамилия, особенно частая в Полтавской, Черниговской, Харьковской и Сумской областях. География подсказывает, что прозвище Новоженый бытовало именно в среде запорожского казачества и украинского крестьянства, где фамилии на -енко стали массово оформляться в XVI–XVII веках.

Словообразовательная модель проста: от прилагательного «новоженый» (новобрачный) отсекли окончание и добавили суффикс -ко. В украинской традиции это типичный способ превратить прозвище в родовое имя. Интересно, что в русских переписях XVII–XVIII веков встречаются варианты написания Новоженой, Новоженнов, Новоженинов — все они однокоренные, но суффикс -енко указывает именно на выходцев с территории Речи Посполитой или Гетманщины.

Версия о происхождении от названия населённого пункта (например, гипотетического села Новоженовка) маловероятна: топонимы с таким корнем на карте не зафиксированы. Также не стоит путать фамилию с редким русским прозвищем Новоженя, которое могло означать не только молодожёна, но и человека, который женился повторно. Для украинской ветви Новоженко основное значение — «потомок того, кого прозвали новожёном», то есть человек, чей предок запомнился окружающим тем, что недавно создал семью.