Фамилия Обедкин образована от прозвища или нецерковного имени Обедка. В основе лежит слово «обед» — приём пищи в середине дня. Прозвище Обедка могли дать человеку по разным причинам: либо он любил плотно и сытно поесть, либо, напротив, был неумерен в еде, либо его обязанность или привычка были связаны с обеденным временем. В крестьянском быту, где распорядок дня жёстко привязывался к световому дню и работам, прозвище по времени приёма пищи было вполне естественным.

Сам суффикс -кин типичен для русских фамилий, образованных от имён и прозвищ на -а/-я. Обедка → Обедкин означает «сын Обедки». Модель с суффиксом -ин (-кин) — одна из древнейших в русской антропонимии, она закрепилась в северных и центральных областях России. В южных и западных регионах чаще встречается суффикс -ов/-ев, так что фамилия Обедкин — характерный признак северного или центрального происхождения.

В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» упоминаются фамилии, образованные от названий приёмов пищи: Обедов, Обедков. Обедкин стоит в том же ряду, но с другим суффиксом. Это не массовая фамилия: в современных телефонных справочниках и базах данных она встречается редко, в основном в Поволжье и на Урале. Возможно, предок носителя фамилии владел постоялым двором или кормил работников — тогда прозвище могло стать профессиональным.

Есть и альтернативная, менее вероятная версия: связь с диалектным словом «обедь» — обман, хитрость. В некоторых говорах «обедка» могло означать обманщика. Но эта гипотеза слабая: основное значение слова «обед» в русском языке устойчиво и широко, а прозвища от бытовых реалий встречаются гораздо чаще, чем от редких диалектизмов. Похожая фамилия Обедов фиксируется в документах XVI века, что подтверждает древность модели.