Фамилия Онаньев — редкий пример того, как церковное имя, попав в народную речь, дало неожиданную словообразовательную ветвь. В основе лежит каноническое имя Ананий (др.-евр. «благодать Божья» или «Бог милостив»). В русском просторечии начальное «а» часто отпадало, а «н» удваивалось: Ананий превращался в Онаний, отсюда и форма Онаньев.

Суффикс -ев указывает на отчество второго порядка: Онаньев буквально значит «сын Онанья» (внук Анания). Модель типична для северных и центральных регионов России, где фамилии на -ев активно вытесняли патронимы на -ин. Если бы фамилия образовалась напрямую от уменьшительной формы (Онаня), мы бы получили Онаньин, но здесь мы видим именно притяжательное прилагательное от полного имени.

Сложность в том, что в русском языке слово «онанизм» и производные от него — позднего, книжного происхождения (XVIII–XIX века, из западноевропейских медицинских трактатов). Связь с фамилией чисто фонетическая и случайная: Онаньев старше этого термина как минимум на два столетия. В документах XVI–XVII веков встречаются крестьяне и посадские люди Онаньевы в Новгородской и Вятской землях — там имя Ананий было особенно популярно.

Встречается также вариант Онаньев с двойным «н» в корне, что иногда путают с украинской фамилией Онаненко. Но русская форма строго держится суффикса -ев, а не -енко. Если ваш предок носил эту фамилию, он почти наверняка происходил из среды черносошных крестьян или ремесленников русского Севера, где имя Ананий давали часто в честь святого Анания Апостола.

Филологически фамилия интересна тем, что сохранила архаичное произношение с «о» вместо «а» — так говорили в старых русских говорах, где аканье ещё не победило.