Фамилия Онистратенко — яркий пример украинской антропонимии, где суффикс -енко играет ключевую роль. В XVI–XVIII веках в Поднепровье так образовывали фамилии от имени или прозвища отца, указывая на прямую родственную связь: «чей?» — «Онистратов». Со временем -енко закрепилось как стандартный суффикс для всей семьи, а не только для младшего поколения.

Основа фамилии — имя Онистрат. Это народная, восточнославянская переработка греческого канонического имени Каллистрат (Καλλίστρατος), которое означает «прекрасновоин», «добрый воин». В русском и украинском просторечии начальное «ка» часто отпадало, а «л» упрощалось: Каллистрат → Онистрат. Со временем имя почти вышло из обихода, но фамилия сохранила его в «застывшей» форме.

Интересна деталь, которая отличает эту фамилию от, например, Онищенко или Онуфриенко. В имени Онистрат есть редкий для украинской традиции случай сохранения полного варианта имени без сокращения. Обычно Каллистрат превращался в Онисько или Онишко, а здесь основа осталась трёхсложной. Это указывает на то, что фамилия могла закрепиться в среде, где имя произносили чётко, возможно, под влиянием церковной грамотности или в регионе, где греческие формы держались дольше.

Географически фамилия тяготеет к центральным и северным областям Украины — Черкасской, Киевской, Полтавской. Там же встречаются более редкие варианты — Онистрат, Онистратов, Онистратенков. Сословная история простая: в реестрах казацкой старшины и мещан XVII–XVIII веков эта фамилия не попадается, что говорит о крестьянском или рядовом казачьем происхождении. Носители фамилии, скорее всего, были потомками людей, которых в документах записывали просто по отцу — Онистратов сын, а затем фамилия закрепилась в форме Онистратенко.