Фамилия Онисенко относится к распространенному типу украинских фамилий и образована от крестильного имени Онисий. Мужское крестильное имя Онисий в переводе с греческого означает «исполнение», «завершение», «польза». В основу фамилии Онисенко, возможно, легла его производная форма – Ониса. Среди покровителей имени - Святой мученик Онисий, который жил в Палестине. За исповедание веры во Христа он был усечен мечом. Поэтому Онисенко буквально понималось как «сын Онисы».