Фамилия Пачкалева — женская форма фамилии Пачкалев, и её происхождение уходит корнями в южнославянскую языковую среду, скорее всего, в болгарский или македонский ареал. На это указывает характерный суффикс -ев, который в русской традиции закрепился за фамилиями, образованными от основ на мягкий согласный или от иноязычных имен и прозвищ. В отличие от массовых русских фамилий на -ов, здесь мы видим след балканского влияния: фамилии на -ев в Болгарии и Сербии столь же обычны, как на -ов в России.

Основа фамилии — «Пачкал» — восходит к личному имени или прозвищу. Наиболее вероятная версия связывает её с болгарским словом «пачкал», которое означает «неряха», «грязнуля», «тот, кто пачкает». В этом случае фамилия Пачкалев (и Пачкалева) — типичное «прозвищное» образование, какими были, например, русские Грязнов или Замараев. Прозвище могло закрепиться за человеком не только из-за неопрятности, но и в переносном смысле — за нечистоплотностью в делах или за профессиональной особенностью (например, маляр, печник или работник с сажей).

Менее распространённая версия выводит «Пачкал» из уменьшительной формы крестильного имени. В болгарском именослове есть редкие формы вроде Пачо (от Павел или Паисий), и «Пачкал» могло быть ласкательным производным. Однако эта гипотеза слабее, так как для уменьшительных форм типичнее суффиксы -чо, -ко, а не -кал. Прямых подтверждений в ономастических словарях нет, поэтому прозвищная версия остаётся основной.

Географически фамилия Пачкалева редка и в России, и в Болгарии. Встречается преимущественно в южных регионах России, куда в XIX–XX веках переселялись болгары и гагаузы, а также в среде потомков болгарских беженцев. В современной Болгарии фамилия Пачкалев фиксируется в единичных случаях, в основном в областях, граничащих с Македонией. Таким образом, носительница фамилии Пачкалева, скорее всего, имеет южнославянские корни, и её предок получил прозвище за небрежность или род занятий, связанный с пачканьем.