Фамилия Падунова — женская форма, а мужская, Падунов, в свою очередь, образована от прозвища или мирского имени Падун. В основе лежит глагол «падать». Сразу стоит отбросить бытовую версию о «неуклюжем, падающем на ровном месте» человеке: прозвища редко давались по случайным качествам. Слово «падун» в русских говорах имеет вполне конкретные значения.

В первую очередь, Падун — это водопад или порог на реке, где вода «падает» с уступа. Такое прозвище мог получить человек, живший у бурного переката, или же тот, чья профессия была связана со сплавом леса и преодолением порогов. В Сибири и на Урале это слово было особенно распространено: например, знаменитый Падунский порог на Ангаре. Следовательно, предки носителя фамилии вполне могли быть речниками, лоцманами или просто жителями села, стоящего на речном перекате.

Есть и вторая, менее очевидная версия. В некоторых диалектах «падун» называли овраг, лог, промоину в земле — место, где грунт «падает» или осыпается. Фамилия могла закрепиться за крестьянином, чей надел находился у такого оврага, или за тем, кто жил в низине, в «пади». Оба варианта — топонимические, то есть описывают место жительства, а не характер человека.

Суффикс -ов (в женском роде -ова) указывает на принадлежность: Падунов — сын Падуна. Это классическая русская модель образования фамилий, типичная для центральных и северных регионов. Встречается фамилия относительно редко, и её география тяготеет к северу и востоку: Вологодчина, Архангельская область, Урал, Сибирь. Если ваши предки оттуда, версия с речным порогом или оврагом становится почти бесспорной.