Фамилия Пахатинский ведет свое начало от названия деревни Пахатино, расположенной в Вышневолоцком районе Тверской губернии. Сам топоним, предположительно, образован от глагола «пахать», то есть «орать, взрывать ниву, землю под посев плугом, сохой, косулей». Таким образом, вполне вероятно, что основатель рода Пахатинских был выходцем из этого населенного пункта. Согласно другой гипотезе, фамилия Пахатинский восходит к прозвищу Пахата, которое также этимологически связано с глаголом «пахать». Исходя их этого, можно предположить, что прозвище указывало как на род занятий человека, так и на его социальное положение: возможно, предок современного носителя фамилии был крестьянином, земледельцем, оратаем.