Фамилия Пахотников образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Прозвище Пахотник восходит к глаголу «пахать» - «орать, взрывать ниву, землю под посев плугом, сохой, косулей». Очевидно, оно относилось к числу именований, указывавших на род занятий человека: пахотником называли крестьянина, земледельца, того, кто пашет. В старину говорили: «Не будет пахотника, не станет и бархатника». Скорее всего, основатель рода Пахотниковых был из крестьянской семьи. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Пахотник, со временем получил фамилию Пахотников. О точном месте и времени возникновения фамилии Пахотников в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Пахотников представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.