Фамилия Палубецкас — один из тех случаев, когда литовское происхождение видно сразу, даже без специальных знаний. Суффикс -ас в конце фамилии — это типичный литовский показатель мужского рода в именительном падеже. В русском языке такие фамилии часто склоняются по образцу существительных мужского рода, а в литовском оригинале звучат как Палубецкас (Palubeckas).

Основа фамилии — палуб(а). В литовском языке žodis «palubė» означает «подволока» или «потолок», а «palubė» — это пространство под потолком. Однако здесь, скорее всего, не прямое значение, а прозвище. Человек по прозвищу Палуба мог быть высоким, достающим до потолка, или, наоборот, низким, «подпотолочным». Есть и другая версия: фамилия могла образоваться от названия ремесла — мастера, который делал потолки или настилал палубы (в судостроении). Но для Литвы, не имевшей выхода к морю, судоходная версия менее вероятна, чем бытовое прозвище.

Фамилия Палубецкас — явно не древняя шляхетская, а крестьянская или мещанская. В Литве такие фамилии на -ас массово закрепились в XIX веке, после отмены крепостного права, когда крестьянам давали постоянные фамилии. До этого люди могли обходиться прозвищами, которые и легли в основу.

Географически фамилия тяготеет к восточной Литве и, возможно, к пограничным с Беларусью районам. Литовский суффикс -eck- (в русской передаче -ецк-) встречается в фамилиях, образованных от названий мест, но в случае с Палубецкас основа не топонимическая, а прозвищная.

В русскоязычной среде фамилию часто воспринимают на слух как польскую или белорусскую из-за сочетания «-ецк-», но окончание -ас выдает литовское происхождение. Носители фамилии могли быть ремесленниками или крестьянами, жившими в небольших местечках. Известных исторических личностей с такой фамилией нет, что только подтверждает её простонародное происхождение.