Фамилия Палубин — редкий пример, где на первый взгляд прозрачная основа оборачивается лингвистической загадкой. В ней отчётливо слышится корень «палуб-», который в русском языке ассоциируется с корабельной палубой или колодой карт, но происхождение фамилии, скорее всего, лежит в совершенно другой плоскости.

Самая вероятная версия — фонетическая. В русских говорах, особенно на северо-западе и в Поволжье, слово «полуба» означало «полушубок», тулуп из овчины. Человека, который шил такие полушубки или постоянно ходил в полубе, могли прозвать Палуба. Фамилия Палубин — это притяжательное прилагательное, отвечающее на вопрос «чей?»: сын Палубы. Суффикс -ин указывает на принадлежность к конкретному человеку, а не к целому роду занятий (как было бы с суффиксом -ов). Таким образом, предок носителя фамилии был либо скорняком, либо просто обладателем характерной одежды.

Менее очевидная, но возможная версия — связь с прозвищем Палуба от диалектного глагола «палубить» — «валить, рубить лес», то есть «лесоруб». В этом случае фамилия указывала бы на род занятий: «Палубин» — «сын лесоруба». Третья, самая спорная версия — от слова «палуба» в значении «настил, пол». Прозвище могли дать плотнику, который клал полы, но эта гипотеза слабее, так как в русской ономастике такие прозвища почти не встречаются, а «палуба» в значении «пол» — слово редкое и книжное.

Географически фамилия тяготеет к центральным и северным областям России. Встретить её можно в старых писцовых книгах Новгородской и Вологодской губерний, что косвенно подтверждает версию о северных говорах и слове «полуба». В дворянские роды Палубины не попали — это крестьянская или мещанская фамилия, образованная от прозвища по профессии или внешнему признаку. Сейчас она остаётся малочисленной, что делает её любопытным объектом для семейного поиска: каждый её носитель, скорее всего, является потомком одного или нескольких родоначальников из одного региона.