Фамилия Палунина — женская форма от Палунин, а та, в свою очередь, образована от прозвища или имени Палуня. Чтобы понять корень, нужно отбросить типичный русский фамильный суффикс -ин, который в этом случае указывает на принадлежность: «чей?» — Палунин, то есть сын или потомок Палуни. Сама основа Палуня — это разговорная, уменьшительная форма от канонического крестильного имени Палладий (от греческого «палладион» — статуя богини Афины, а в переносном смысле — защита, оплот). В русской народной традиции сложные греческие имена часто укорачивали до простых и бытовых форм: Палладий превращался в Палу, Палушу, а затем и в Палуню.

Однако есть и другая, более прозаичная версия. В северных и сибирских говорах словом «палун» называли половинку чего-либо, а «палунить» означало «делить пополам». В этом случае прозвище Палуня мог получить человек, который занимался дележом добычи, земли или товара, либо тот, кто родился неполноценным, «половинчатым» (например, слабым или младшим из двойни). Такой вариант правдоподобен, если фамилия бытует в регионах с сильным диалектным влиянием — в Архангельской, Вологодской или Пермской областях.

С точки зрения словообразования, фамилия Палунина — типичный пример «матронима» или «патронима» на -ин. Этот суффикс был особенно распространен на севере и в центральной России, где часто спрашивали не по отчеству, а по имени матери или отца в уменьшительной форме. Если у вас именно женский вариант Палунина, то исторически это могла быть фамилия, закрепленная за женщиной (вдовой или дочерью) без перехода в мужскую форму, хотя в современном употреблении это просто грамматический вариант для женщины.

Сословная принадлежность предков Палуниных не закреплена однозначно. Фамилия не относится к дворянским или княжеским — скорее всего, это крестьянский или мещанский род. Встречаемость фамилии невысокая, она редкая, что делает её хорошим маркером для генеалогического поиска: скорее всего, все современные Палунины восходят к одному-двум корням. Если вы ищете своих, стоит обратить внимание на Вятку, Пермский край и Урал — там фамилия фиксируется в метрических книгах XIX века.