Фамилия Палунин — один из тех случаев, когда основа на слух кажется простой, а на деле требует разбора диалектных и словообразовательных нюансов. Если отбросить суффикс -ин, который в русских фамилиях указывает на принадлежность («чей?» — сын Палуны), остаётся корень «Палун-». Самая прямая и правдоподобная версия связывает его с диалектным словом «палун» — так в некоторых говорах (особенно северных и сибирских) называли сильный ветер, бурю, шквал. Человек мог получить прозвище Палун за буйный нрав, порывистый характер или, наоборот, за профессию, связанную с морем и погодой — например, опытный моряк, который чуял ветер.

Вторая версия менее очевидна, но имеет право на существование: «палун» как фонетический вариант слова «полундра» (морской возглас тревоги) или сокращение от «полуночник» — тот, кто работает или бодрствует ночью. Однако эта гипотеза слабее, потому что в русских говорах зафиксирован именно «палун» в значении «ветер», а не «ночной человек». Фамилия образована по простой и древней модели: прозвище + -ин, что типично для крестьянской и мещанской среды центральной и северной России.

Интересна география фамилии. Палунины — не столичная фамилия, её следы ведут в Вятскую, Вологодскую, Архангельскую губернии, а также на Урал. Это косвенно подтверждает «ветреную» версию: север и Урал — края, где погода диктует быт, а прозвища по природным явлениям были в ходу. Встречается фамилия и в форме Палунов (с суффиксом -ов), что характерно для южных регионов, но Палунин — более архаичный вариант, сохранившийся на севере.

В написании фамилии нет спорных моментов: она всегда писалась через «а» в первом слоге (не Пулунин). Редкая фамилия, не имеющая знаменитых носителей в истории, — это не минус, а указание на её сугубо народное, крестьянское происхождение. Предки современного Палунина, скорее всего, были людьми, чьи прозвища рождались из наблюдений за природой: либо «ветреный» человек по характеру, либо тот, чья работа зависела от погоды — рыбак, охотник, извозчик.