Фамилия Панииван — редкая и необычная по звучанию, что сразу наводит на мысль о её нерусском происхождении. Разбор её состава показывает, что это сложная основа, которая не укладывается в стандартные славянские словообразовательные модели. Наиболее вероятная версия связывает фамилию с украинским или белорусским прозвищем, которое возникло из двух частей: «пан» и «Иван». Первая часть, «пан», в польском, украинском и белорусском языках означала «господин», «барин», «помещик» или просто вежливое обращение к мужчине. Вторая часть — это распространённое календарное имя Иван. Таким образом, прозвище Панииван могло означать «господин Иван» или «барин Иван» — так могли называть либо реального владельца земли по имени Иван, либо, с иронией, простого крестьянина, который вёл себя важно и по-барски.

Суффикса в классическом понимании в этой фамилии нет: окончание -н указывает на то, что фамилия застыла в форме прозвища или имени, не получив типичного русского суффикса принадлежности (-ов, -ин). Такая модель — превращение прозвища в фамилию без добавления суффикса — встречается в украинской и белорусской ономастике, особенно в западных регионах, где было сильно польское влияние. В русской традиции подобное прозвище скорее превратилось бы в Паниванов или Паниванин, но форма Панииван сохранила исходное звучание.

Вторая, менее вероятная версия, рассматривает фамилию как искажённое тюркское или румынское имя. Например, в румынском языке есть слово «pană» (перо), а «Ivan» — форма имени Иоанн, но сочетание выглядит искусственным. Тюркские корни тоже маловероятны, так как первая часть «пани» не характерна для тюркских языков. Поэтому версия с украинско-польским прозвищем остаётся основной и самой логичной.

Географически фамилия тяготеет к западу Украины и Беларуси, а также к смежным регионам Польши. В исторических документах фамилия не фиксируется в дворянских родословных книгах Российской империи, что косвенно указывает на крестьянское или мещанское происхождение её носителей. Скорее всего, предок получил прозвище в сельской среде, где ироничное «пан» было распространённым способом подколоть человека за его манеры или зажиточность. Носители фамилии сегодня встречаются в России, Украине и Беларуси, но их немного — это редкая фамилия, не входящая даже в первые сотни тысяч по распространённости.