Фамилия Папенина — женская форма фамилии Папенин, и её происхождение, скорее всего, связано с разговорным или диалектным словом «папеня». В старых русских говорах так могли называть маленького ребёнка, неженку или избалованного сыночка — от слова «папа» с уменьшительно-ласкательным суффиксом -еня. Соответственно, фамилия образована по модели «чей?»: Папеня → сын Папени → Папенин, то есть «принадлежащий Папене». Суффикс -ин типичен для русских фамилий, образованных от прозвищ или имён, оканчивающихся на -а/-я.

Менее вероятна, но возможна связь с основой «папа» в значении «отец»: прозвище Папеня могли дать любимчику отца или, напротив, «маменькиному сынку». В этом случае фамилия несёт скорее бытовую, а не профессиональную характеристику предка.

Географически фамилия редкая и не имеет ярко выраженного «гнезда» в одном регионе, что характерно для поздних или случайных прозвищных фамилий. В отличие от массовых фамилий на -ов/-ев, Папенин не встречается в списках дворянских родов или купеческих династий — это типичная крестьянская или мещанская фамилия, закрепившаяся за одной семьёй.

Стоит обратить внимание на орфографию: в некоторых источниках можно встретить вариант Папенина с ударением на второй слог (Папéнина), что указывает на происхождение от имени Папа или Папка через форму Папеня. Если ударение падает на последний слог (Папенинá), это может быть искажением или диалектной особенностью.

Таким образом, предок носительницы фамилии Папенина — человек, которого в деревне или городе звали Папеней. Кем он был по профессии, сказать сложно, но прозвище указывает либо на его юный возраст, либо на характер — изнеженность или привязанность к отцу.