Фамилия Пашутин ведет начало от крестильного имени Павел, которое в переводе с греческого означает «маленький». Основой для фамилии послужила уменьшительно-ласкательная форма Пашута. Так на Руси называли младших сыновей или просто любимых детей, и это имя, в отличие от полного, чаще звучало в быту, в кругу семьи и соседей. Потомок человека по имени Пашута со временем получал фамилию Пашутин, отвечая на вопрос «чей ты?» — Пашутин сын, внук или правнук.

Форма Пашута относится к пласту народных, разговорных вариантов канонических имен, которые в старину были распространены шире, чем их официальные аналоги. Суффикс -ут- в данном случае имеет уменьшительно-ласкательное значение, как в именах Машута (от Мария) или Ванюта (от Иван). Это типичная словообразовательная модель, по которой строились многие русские фамилии: если в основе лежало имя на -ута, то фамилия получала окончание -ин, указывающее на принадлежность роду. Поэтому Пашутин стоит в одном ряду с такими фамилиями, как Ванютин, Машутин или Костютин, и хорошо показывает, как личное прозвище отца становилось родовым прозванием всей семьи.

Примечательно, что фамилия Пашутин сохранила архаичную форму, которая сегодня может звучать непривычно для носителей литературного языка. В современном русском языке чаще употребляется форма Пашутов, образованная по более продуктивной модели с суффиксом -ов. Однако вариант Пашутин закрепился в документах и передавался из поколения в поколение, что делает его ценным свидетельством живой народной речи прошлого. Это не ошибка письмоводителя, а отражение реального произношения, которое бытовало в той местности, где фамилия возникла.

Стоит добавить, что имя Пашута могло закрепляться не только за детьми, но и за взрослыми мужчинами в качестве внутрисемейного прозвища. В крестьянской среде, где полные имена употребляли редко, человека часто звали по отцу или по деду, и уменьшительная форма приживалась как самостоятельное имя. Поэтому носитель фамилии Пашутин не обязательно был прямым потомком человека, которого официально звали Пашута, — иногда достаточно было того, что так его называли в округе. В любом случае, в основе фамилии лежит теплое, домашнее обращение, что выделяет ее среди более официальных образований от полных имен.