Фамилия Пашутов — довольно редкая и интересная с точки зрения словообразования. Она образована от имени Пашута, которое является уменьшительно-ласкательной формой крестильного имени Павел (в переводе с латинского — «малый, скромный»). В русском языке существовал целый ряд производных форм от Павла: Паша, Пашка, Пашуня, Пашута. Именно последняя, с суффиксом -ут-, и легла в основу фамилии. Суффикс -ут- в русских именах встречается нечасто (сравните: Ванюта, Мишута), что делает эту фамилию более самобытной, чем стандартные Пашков или Пашин.

Фамилия построена по простой и распространённой модели: имя (или прозвище) + притяжательный суффикс -ов. Пашутов буквально означает «сын Пашуты» или «принадлежащий Пашуте». Такой тип фамилий был характерен для всех сословий, но особенно закрепился в крестьянской и мещанской среде центральной России и Поволжья. Встречается она преимущественно в северных и центральных областях — в Вологодской, Архангельской, Кировской областях, а также в Пермском крае, куда переселенцы приносили свои фамилии в XVII–XIX веках.

Гораздо менее вероятна, но теоретически возможна версия происхождения от прозвища Пашута, связанного с глаголом «пахать» или «пашущий». В говорах «пашута» могли назвать трудолюбивого, работящего человека, который «пашет как лошадь». Однако ономастика отдаёт предпочтение первой версии: подавляющее большинство русских фамилий на -утов образованы от личных имён, а не от нарицательных слов. Прямых аналогов фамилии от слова «пахать» (вроде Пахарёв или Пахалов) в русском языке гораздо больше, и они строятся по другим моделям.

Известных исторических деятелей с фамилией Пашутов нет, что подтверждает её сугубо народное, непридворное происхождение. Это фамилия простого человека, чей предок носил домашнее имя Пашута — ласковое обращение к Павлу, которое со временем стало родовым.