Фамилия Педорина — женская форма, мужская — Педорин. Она образована по самой распространённой в русском языке модели: от основы, оканчивающейся на согласный, с помощью суффикса -ин, который исторически указывал на принадлежность («чей?» — Педорин, то есть сын или потомок Педори). Основной вопрос — что стоит в корне.

Здесь возможны два основных объяснения, и оба связаны с диалектной или просторечной лексикой.

Первая версия отсылает к слову «педора» — в некоторых южнорусских и украинских говорах так называли неопрятного, неряшливого человека или того, кто делает всё медленно, с ленцой. Прозвище Педоря могли дать нерадивому работнику или неаккуратному хозяину. Фамилия в таком случае — из числа «характеристических», описывающих поведение или внешность предка.

Вторая версия — более редкая, но лингвистически возможная. В старых псковских и тверских говорах фиксировался глагол «педо́рить» со значением «упрямиться, капризничать, делать по-своему». От него могло возникнуть прозвище Педоря для строптивого, своенравного человека. Эта версия менее распространена, но хорошо объясняет суффикс -ин при мужской основе: Педоря → Педорин.

Фамилия Педорина не относится к числу широко распространённых. Она встречается преимущественно на юге России (Воронежская, Ростовская области) и в некоторых районах Украины, что согласуется с первой, южнорусской версией происхождения. В центральных областях она редка.

В отличие от фамилий, образованных от крестильных имён (Иванов, Петров), Педорина — типичная «прозвищная» фамилия. Предок получил её не по имени отца, а по отличительной черте характера или бытовой привычке, которая закрепилась за родом. Сословной привязки нет: прозвище могло возникнуть в крестьянской, мещанской или казачьей среде.

В написании фамилии путаницы нет: она всегда пишется через букву «е» в первом слоге. Вариант «Пидорина» (через «и») — ошибочный и не связан с этимологией, хотя иногда встречается из-за произносительной нормы в безударной позиции.