Фамилия Педрилкин явно происходит от прозвища или неканонического имени Педрилка. Основа здесь — «педрил-» с суффиксом -к(а), который в русских прозвищах часто придаёт оттенок уменьшительности, пренебрежения или шутливости. Сам корень «педр-» — тёмный и неоднозначный. Самая прямая версия: это вариант древнерусского имени Пётр, которое в народной речи давало множество форм: Петруха, Петруня, Петрила, а также Педря, Педрила. Чередование «т» и «д» в диалектах встречается (ср. «Петр» и просторечное «Педро» или «Педя»). Тогда Педрилка — это уменьшительное от Педрила, то есть «маленький Пётр» или «Петрушка» в пренебрежительном смысле.

Вторая версия, менее вероятная, но возможная в северных говорах: связь с диалектным словом «педра», означающим неряху, неопрятного человека. В таком случае прозвище Педрилка могли дать неопрятному или небрежному человеку. Однако для фамилий на -ин/-кин характернее происхождение от личного имени, а не от нарицательного прилагательного.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Педрилкин буквально значит «сын Педрилки» или «человек из семьи Педрилки». Такая модель типична для северных и центральных областей России, где фамилии на -ин широко распространены. Географически фамилия редкая и локальная — её носители в основном встречаются в Поволжье и на Урале, что косвенно подтверждает версию об имени Пётр: в этих регионах любили народные формы канонических имён.

Никаких дворянских родов или известных исторических личностей с фамилией Педрилкин не зафиксировано. Это крестьянская или мещанская фамилия, возникшая не позднее XVII–XVIII веков, когда безфамильные крестьяне получали прозвища по отцу. Со временем написание закрепилось, и сегодня это просто редкая русская фамилия с неочевидным, но объяснимым корнем.