Фамилия Пеккоев — редкий случай, когда географический акцент почти наверняка перевешивает все прочие версии. Она отчетливо отсылает к северному Приладожью и Карелии, где фамилии на -ев с основой на -о встречаются чаще, чем в средней полосе. Пеккоев — это, скорее всего, русифицированный вариант карельской или финской фамилии Пекконен (Pekkonen), образованной от имени Пекка — народной формы библейского Петр. Когда носители такой фамилии попадали в русскоязычную среду, суффикс -нен нередко заменяли на русский патронимический -ев, а конечное «а» основы (Пекка) отпадало, давая Пекко-ев.

Вторая версия, менее вероятная, но не исключенная, — происхождение от прозвища Пекко. В некоторых говорах «пекко» могло означать нечто связанное с печением, пекарем, либо быть искаженным вариантом слова «пекло» (жар, ад). Однако у этой гипотезы нет такой мощной этнической и географической поддержки, как у карельской. Если бы фамилия была распространена, скажем, в Вологодской или Архангельской губерниях вне зон традиционного расселения карел, можно было бы говорить о прозвище, но Пеккоевы в своем большинстве — выходцы из Олонецкой губернии и сопредельных районов.

Модель образования проста: суффикс -ев указывает на принадлежность («чей?»), то есть Пеккоев — это «сын Пекко» или «сын Пекки». Двойное «к» в основе (Пекко-, а не Пеко-) — следствие адаптации карельского произношения, где смычный звук мог быть более твердым и долгим. В русской записи это закрепилось как удвоение.

Таким образом, предок носителя фамилии Пеккоев почти наверняка был карелом или ингерманландцем (финном-лютеранином) по имени Пекка, который в документах XVII–XIX веков был записан как Пеккоев, а не Пекконен. Фамилия недвусмысленно указывает на северо-западное происхождение рода и на то, что предки говорили на прибалтийско-финском языке.