Фамилия Пеклун — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу фамилии, сохранилось почти в первозданном виде, без типичных для русских фамилий суффиксов -ов или -ин. Она образована напрямую от прозвища Пеклун, а то, в свою очередь, восходит к глаголу «пеклевать». Слово это означало «чисто, мелко молоть и просеивать», то есть доводить зерно до состояния тонкой, воздушной муки высшего сорта.

Прозвище Пеклун, скорее всего, закрепилось за человеком, который профессионально занимался молотьбой и просеиванием злаковых культур. В старину это был отдельный и уважаемый промысел: от качества просеивания зависела белизна и чистота муки, а значит, и цена хлеба. Не исключено, что предок носителя фамилии был не просто мельником, а мастером, который готовил так называемую пеклеванную муку, либо торговал ею. Торговля таким товаром считалась делом прибыльным, но требовала и сноровки, и безупречной репутации — обмануть с качеством муки было легко, а потерять доверие ещё легче.

Само слово «пеклеванный» сегодня почти вышло из употребления, но в XIX веке оно было на слуху у каждой хозяйки. Пеклеванный хлеб, испечённый из мелкой, тщательно просеянной муки, считался лакомством и подавался к столу в зажиточных домах. Поэтому прозвище Пеклун могло носить ироничный оттенок — так могли окрестить привередливого едока или того, кто слишком придирчиво относился к еде, но куда вероятнее, что оно указывало на конкретное ремесло.

Интересно, что фамилия не получила дополнительного суффикса — ни уменьшительного, ни притяжательного. Это говорит о том, что она закрепилась в среде, где прозвища были устойчивыми и передавались по наследству без изменений, возможно, в северных или сибирских говорах, где такие формы встречались чаще. По той же модели образованы, например, фамилии Шатун или Болтун, но Пеклун стоит особняком — слишком узкая профессиональная основа.

Встречаемость фамилии невелика, что неудивительно: сам промысел был довольно специфичным, а слово «пеклевать» в большинстве регионов вытеснили более простые глаголы «молоть» и «сеять». Носители фамилии Пеклун, вероятно, рассеяны по разным областям России, и в каждом случае их предки могли быть либо мельниками, либо крупчаниками — мастерами по производству самой лучшей муки. Точной географии фамилии в открытых источниках нет, но сам корень указывает на центральные земледельческие губернии, где пеклевание было особенно развито.