Фамилия Пелля — редкий случай в русском ономастиконе. Её происхождение неочевидно, и, скорее всего, перед нами не исконно русская фамилия, а адаптированное иноязычное имя или прозвище. В пользу этого говорит окончание -я, которое нетипично для русских фамилий, образованных от прозвищ или профессий (обычно это -ов, -ев, -ин). В русском языке фамилии на -я чаще всего либо финно-угорского, либо прибалтийского происхождения, либо являются русифицированной формой иностранной фамилии.

Наиболее вероятная версия связывает фамилию Пелля с финским словом pelto (поле). В финском языке слово «поле» звучит как «пельто», но в некоторых диалектах или в усечённой форме могло дать основу «Пелля». Финские и карельские фамилии на -я не редкость для северо-запада России, особенно для территорий бывшей Ингерманландии (современные Ленинградская область, Карельский перешеек). В этом случае фамилия могла означать «живущий у поля» или «земледелец». Подтверждением служит существование топонимов: в Финляндии есть деревня Пелля (Pellä), а в Ленинградской области — посёлок Пелла, основанный ещё при Петре I и названный в честь финского названия местности.

Вторая версия, менее вероятная, но тоже имеющая право на существование, — происхождение от шведского слова päll (глупец, простофиля) или от немецкого Pell (кожура, шелуха). Однако такие прозвища обычно закреплялись в фамилиях с суффиксами, а не в чистом виде. К тому же, в шведском языке фамилия Pell встречается, но форма Пелля для неё нехарактерна.

Встречаемость фамилии крайне низкая. В России она сосредоточена в основном в Санкт-Петербурге и Ленинградской области, что косвенно подтверждает финскую или прибалтийско-финскую версию. Возможно, предки носителей фамилии были ингерманландскими крестьянами или переселенцами из Финляндии, которые после присоединения этих земель к Российской империи получили русские документы с записью фамилии на слух.

Таким образом, фамилия Пелля — скорее всего, географический маркер, указывающий на происхождение из местности, где финно-угорские языки были распространены, а её основа — «поле» или «поляна». Это редкий пример фамилии, которая почти не изменила своего звучания при переходе из одного языка в другой.