Фамилия Пенис — редкий и неоднозначный случай в русской ономастике. Обычно читатель сразу вспоминает латинское penis, но к русским фамилиям это слово не имеет прямого отношения. Настоящее происхождение лежит в народной диалектной лексике, и здесь возможны две основные версии, причем одна значительно правдоподобнее другой.

Самая реалистичная версия связывает фамилию с диалектным словом «пень» или его производными. В северных и сибирских говорах «пенить» означало «упрямиться, упираться, как пень». Прозвище Пень или Пенис (с суффиксом -ис, который в некоторых говорах придавал оттенок «похожий на что-то») могли дать человеку упрямому, неповоротливому или коренастому. Формант -ис здесь не типичный русский суффикс, но в местных говорах (особенно на Русском Севере) встречаются фамилии, образованные через -ис, -ыс: например, фамилия Пенис могла возникнуть из прозвища Пенис — «упрямец, как пень». Слово «пенис» в анатомическом смысле вошло в русский язык только в XVIII–XIX веках через медицинскую латынь, а в народной среде до XX века практически не употреблялось, поэтому случайное совпадение с латинским термином — вторично.

Вторая, менее вероятная версия — связь с украинским или польским словом «пень» (пень) через фамилии типа Пеня, Пенюк. В этом случае суффикс -ис мог быть искажением при записи в документах: писарь мог записать Пенис вместо Пенец или Пенич. Но эта гипотеза слабая, так как фамилия Пенис не фиксируется в массовых списках украинских или польских фамилий.

Географически фамилия Пенис встречается крайне редко. По данным открытых баз, носители живут в основном в центральной России и на Урале, но численность не превышает нескольких десятков человек. В дореволюционных источниках (например, в переписях) фамилия не упоминается — это указывает на её позднее возникновение или на то, что она могла быть изменена при записи. Возможно, часть носителей сменила фамилию в советское время из-за неловкого звучания.

Социальный контекст: фамилия могла принадлежать крестьянам или мещанам. Суффикс -ис не дворянский, а скорее просторечный или диалектный. Никаких известных исторических личностей с этой фамилией нет — это редкий антропоним, который сохранился скорее вопреки, чем благодаря.

Итог: фамилия Пенис — не медицинский курьёз, а диалектное прозвище, означавшее «упрямый человек» или «коренастый, как пень». Современное звучание — случайное совпадение с латинским термином, которое не должно вводить в заблуждение.