Фамилия Пеницына — женская форма фамилии Пеницын, которая образована от прозвища Пеница. В основе, скорее всего, лежит слово «пеница» — в некоторых русских говорах так называли пену, накипь или пенку, которая образуется на поверхности жидкости. Прозвище могли дать человеку суетливому, вспыльчивому, «кипучему», либо, наоборот, тому, кто занимался снятием пенки при варке — например, при изготовлении пива или молочных продуктов. Вторая, менее вероятная версия, связывает прозвище с диалектным «пеня» (укор, упрёк), но для Пеницы это звучит натянуто: суффикс -ица обычно указывает на предмет или признак, а не на действие.

Модель образования типична для русского севера и северо-востока: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей сын?» — Пеницын). В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще встречаются в центральных и южных регионах, -ин характерен для новгородских, архангельских, вятских земель. Если ваш предок носил фамилию Пеницын, он мог происходить из крестьян или посадских людей тех краёв.

Фамилия редкая. В дореволюционных справочниках она не фигурирует среди дворянских родов, а в современных базах встречается эпизодически — в основном в Кировской, Вологодской и Архангельской областях. Это косвенно подтверждает версию о северном происхождении.

С точки зрения словообразования интересен сам корень: «пена» дала не только Пеницына, но и фамилии Пенкин, Пенков, Пенягин. Однако Пеницын стоит особняком — уменьшительно-пренебрежительный суффикс -ица в основе встречается реже, что делает фамилию более индивидуальной, нешаблонной.