Фамилия Пенкин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Пенкин послужило церковное имя Пеон. Существует две версии происхождения фамилии Пенкин. По одной из них, эта фамилия образована от имени Пенка – краткой просторечной формы мужских имен Пеон (от греческого paionios – «врач, целитель»), либо от Феопент (от греческого theos – «бог» и pempo – «посылать»). Согласно другой гипотезе, эта фамилия восходит к прозвищу Пенка, в основе которого лежит нарицательное «пенька» – «грубое лубяное волокно, полученное из стеблей конопли». В этом случае Пенкой могли называть того, кто изготовляет пеньку, либо жесткого, неуступчивого человека. Кроме того, нельзя исключить, что это прозвище дали любителю молочных пенок. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Пенка, со временем получил фамилию Пенкин. О точном месте и времени возникновения фамилии Пенкин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Пенкин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.