Фамилия Панкин — классический пример русской «патронимической» фамилии, то есть образованной от личного имени отца. В основе лежит имя Панка, а суффикс -ин указывает на принадлежность: Панкин буквально означает «сын Панки». Такая модель с суффиксом -ин была особенно распространена в северных и центральных русских землях, где имена, оканчивающиеся на -а или -я, естественно образовывали притяжательные прилагательные.

Само имя Панка — это не самостоятельное имя, а уменьшительная форма целого ряда крестильных имен. Чаще всего его связывают с именем Пантелеймон, что в переводе с греческого означает «всемилостивый». Однако Панкой могли называть и Панкратия (от древнегреческого «панкратос» — «сильнее всех»), и Панфила («всеми любимый»). В быту, где редко использовали полные церковные формы, все эти громкие имена легко сокращались до простого и удобного Панка. Поэтому, не зная точной родословной конкретной семьи, нельзя утверждать, какое именно полное имя носил первый Панка — Пантелеймон, Панкратий или Панфил.

Интересно, что имя Панфил (или Памфил) дало и другие однокоренные фамилии, например, Панфилов, а от Панкратия пошли Панкратовы и Панкратьевы. Фамилия Панкин, таким образом, стоит в одном ряду с этими более «полными» вариантами, но сохранила именно народную, разговорную форму имени. Это делает её ценным свидетельством того, как в живой речи XVI–XVII веков сокращали и адаптировали церковные имена.

Точное время и место возникновения фамилии Панкин назвать сложно — процесс формирования русских фамилий растянулся на несколько столетий, и в разных регионах он шёл с разной скоростью. Крестьянские семьи массово получали фамилии только после отмены крепостного права в 1861 году, хотя отдельные носители фамилии могли появиться и значительно раньше, среди служилых людей или посадского населения. Несмотря на эту неопределённость, фамилия Панкин остаётся замечательным памятником славянской письменности и культуры, сохранившим для нас звучание древнего имени.