Фамилия Пентишкина образована от имени или прозвища Пентишка, и здесь есть две версии, одна из которых заметно правдоподобнее. Начнём с главной: Пентишка — это просторечная, уменьшительная форма церковного имени Пантелей. В народной речи имя Пантелеймон нередко упрощали до Пентелей, а уже от него возникали ласкательные варианты вроде Пентишка. Само имя пришло из греческого и переводится как «всемилостивый», что отсылает к святому Пантелеймону-целителю, очень почитаемому на Руси.

Скорее всего, основатель рода Пентишкиных был человеком из простого сословия. Такие формы имени — с суффиксом -шк- — типичны для бытовой, неофициальной среды, где имя звучало тепло и по-домашнему. Позже, когда от имени Пентишка образовали фамилию с суффиксом -ин, она закрепилась за потомками: Пентишкин, а для женщин — Пентишкина. Суффикс -ин в русских фамилиях указывает на принадлежность: буквально «чей-то», то есть сын или дочь Пентишки.

Менее вероятно, хотя и возможно, что в основе лежит прозвище Пентишка, связанное с нарицательным словом «пентюх». В просторечии пентюхом называли неуклюжего, полного человека или простака. Но здесь стоит сделать оговорку: прозвищная версия слабее, потому что форма Пентишка естественнее выводится именно из имени Пантелей — это подтверждается и чередованием согласных, и тем, что подобные производные встречаются в других фамилиях, например Пентешкин или Пантелеев. Прозвище от «пентюха» скорее дало бы формы вроде Пентюхов или Пентюшкин, а не Пентишкин.

В итоге фамилия Пентишкина — это типичный пример того, как церковное имя, пройдя через народную речь, превратилось в родовое прозвание. За ней стоит не ремесло и не место жительства, а личное имя предка, которого в кругу семьи звали просто Пентишка.