Фамилия Перегорода — редкий пример, когда прозвище перешло в фамилию почти без изменений, без типичных суффиксов -ов, -ин или -ский. Это так называемая «окаменевшая» форма, где исходное слово стало родовым именем сразу. В русской ономастике такие фамилии встречаются нечасто и обычно указывают на то, что прозвище было прочным и ёмким, не требовавшим переоформления.

Основа фамилии — слово «перегорода». В древнерусском языке оно означало не только «перегородка» или «забор», но и «преграда», «заслон», а в переносном смысле — «раздел», «межа». Прозвище Перегорода могли дать человеку, который жил у какой-то заметной перегородки или забора, либо тому, кто постоянно «перегораживал» дорогу, спор, ссору — то есть выступал в роли посредника или, наоборот, препятствия. Вторая версия, менее популярная, но правдоподобная: так могли прозвать плотника или строителя, ставившего перегородки в домах, — ремесленника, работавшего по дереву.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и белорусским землям, где слово «перегорода» (в значении «забор», «огорожа») было в ходу. В центральных и северных областях чаще говорили «перегородка» или «переборка», поэтому именно южный диалектный след делает фамилию локально приметной.

В отличие от однокоренных Перегородов, Перегородин, Перегородский, здесь нет суффикса принадлежности: носитель фамилии Перегорода — это буквально «сам Перегорода», а не «сын Перегороды» или «родом из Перегород». Такая форма могла закрепиться за одним человеком и передаваться без изменений, что говорит о давнем, возможно, ещё допетровском происхождении. Точных данных о дворянском или крестьянском статусе нет, но по модели образования фамилия скорее крестьянская или посадская — прозвища ремесленников и жителей редко попадали в родословные книги.

В современных справочниках фамилия нечастотна, что делает её ценной для тех, кто ищет не «типовой» след, а конкретную, живую историю предка с характерным именем-прозвищем.