Фамилия Перегородиев — из числа тех, что прямо указывают на занятие или место предка. В её основе лежит слово «перегородка» или глагол «перегородить». Вероятнее всего, первый носитель фамилии получил прозвище Перегорода или Перегород — так могли назвать человека, который жил за перегородкой, отдельно от основной общины, либо того, кто занимался строительством изгородей и перегородок. В северных и сибирских говорах «перегородой» называли и особый вид забора, и часть избы, отгороженную для хозяйственных нужд.

Суффикс -ев указывает на принадлежность: Перегородиев — сын или потомок Перегороды. Интересно, что фамилия образована не от прямого корня «город» (как Перегородов), а от «городить»: разница в суффиксе -и- (Перегородиев против Перегородов) говорит о том, что в основе лежит именно глагольная форма, а не географическое название. Это редкий случай, когда словообразовательная модель сохраняет следы древнего прозвища, а не топонима.

Фамилия очень редкая. По данным современных справочников, она не входит даже в сотню тысяч самых распространённых русских фамилий. Встречается в основном в центральных областях России и на Урале, что косвенно подтверждает её бытовое происхождение: в крестьянской среде прозвища, связанные с устройством жилья и хозяйства, были особенно часты. Сословно предки Перегородиевых, скорее всего, относились к крестьянам или посадским людям — дворянские роды с такой фамилией не зафиксированы.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Перегородиев стоит особняком. Фамилии Перегородов, Перегородский встречаются чаще и легче объясняются через населённые пункты вроде Перегороды или Перегородное. А вот форма на -иев намекает на более архаичное прозвище: возможно, предка звали не по месту жительства, а по действию — «он тот, кто перегородил дорогу» (например, спорный участок земли) или «живущий за перегородкой» (отшельник, или просто бедный родственник в отдельном углу избы).