Фамилия Перепрыгина — женская форма фамилии Перепрыгин. Её основа — прозвище или нецерковное имя Перепрыга, которое получил человек за манеру передвигаться: прыгать, скакать, перепрыгивать через препятствия. В русских говорах слово «перепрыга» могли использовать как шутливую характеристику непоседы, вертлявого ребёнка или человека с лёгкой, пружинистой походкой. Образование фамилии типично для северных и центральных областей России: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — сын Перепрыги), в отличие от южнорусского -ов.

У фамилии есть редкая особенность: глагольная основа «перепрыг-» почти не встречается в русском ономастиконе. Сравните с фамилиями Перескоков, Прыгунов — они образованы от существительных, а Перепрыгин — от личного прозвища-глагола в повелительном наклонении (ср. фамилии Трухин от «трухать», Брыкин от «брыкать»). Это говорит о том, что прозвище было метким и закрепилось за конкретным человеком, а не за целым родом ремесленников.

Версия о связи со словом «перепрыг» (прыжок) менее вероятна: тогда фамилия звучала бы как Перепрыгов. Сословно фамилия не элитарная — её могли дать крестьянину или посадскому человеку, чья подвижность или неусидчивость бросалась в глаза односельчанам. Географически фамилия редкая, встречается в основном в Вологодской, Кировской и Пермской областях — регионах, где сохранились архаичные прозвищные формы.

Таким образом, Перепрыгина — это фамилия-характеристика. Предок носителя, скорее всего, был живчиком, которого в деревне прозвали Перепрыгой за манеру не ходить, а скакать. Никакой мистики или иностранных корней — чисто русская бытовая ономастика с глагольной основой.