Фамилия Перховская — женская форма от Перховский, и её разбор стоит начать сразу с суффикса -ск-, который указывает на польское или западнорусское происхождение. Такие фамилии чаще всего образовывали от названий населённых пунктов: села, местечка или усадьбы. Перховский — тот, кто родом из места с корнем «Перхов» или «Перхово». А вот с основой сложнее: здесь возможны два пути, и оба имеют право на жизнь.

Первый и самый прямой — топонимический. В Беларуси и на западе России встречаются деревни с названием Перхово (например, в Витебской области). Тогда фамилия Перховский — классический «географический» маркер: помещик или крестьянин, владевший землёй в Перхове или переселившийся оттуда. Второй вариант — от прозвища Перх, которое в русских говорах могло означать «перхоть», «шелуха», а в переносном смысле — неопрятного или суетливого человека. Однако такая версия менее вероятна: суффикс -ск- почти не использовался для образования фамилий от прозвищ в крестьянской среде, он был прерогативой дворянских и шляхетских родов.

Есть и третья, более редкая нить: фамилия может восходить к личному имени Перх (уменьшительное от Перфилий, греческого происхождения). В этом случае Перховский — «сын Перха», но опять же через суффикс -ск-, что нехарактерно для русской патронимической модели. Поэтому правдоподобнее всего видеть в Перховской именно шляхетскую или однодворческую фамилию, привязанную к конкретному имению.

В польском языке слово «perch» означает «окунь», а «perchówka» — рыболовную снасть, но связь с фамилией возможна лишь в том случае, если основа — от прозвища рыбака. Однако это скорее совпадение, чем прямое родство.

Сейчас фамилия Перховская встречается нечасто, заметна в западных областях России и в Беларуси, что подтверждает её западнорусские корни. В дворянских родословных книгах эта фамилия не значится, но могла принадлежать мелкопоместной шляхте, которая после разделов Речи Посполитой перешла в сословие однодворцев.