Фамилия Пернюк — пример редкой для русского слуха модели, в которой украинский суффикс -юк наложился на основу, не сразу поддающуюся толкованию. Чтобы понять её происхождение, стоит начать с географии: фамилии на -ук/-юк (Петрук, Бойчук, Романюк) типичны для западноукраинских земель, особенно Волыни, Подолья и Галичины. Пернюк, скорее всего, оттуда же, а значит, её основа — прозвище или имя, бытовавшее в этих краях.

Корень «Перн-» может восходить к нескольким источникам. Самая прямая версия — от украинского «пернач» (вид булавы, оружие казацкой старшины) или «пернатий» (крылатый, пернатый). В таком случае Пернюк — потомок человека, которого прозвали за связь с оружием (возможно, носил пернач как знак власти) либо за лёгкость, быстроту («пернатый» как метафора). Менее очевидный, но возможный вариант — от имени Перун, хотя для прямого отчества форма была бы «Перунюк» или «Перунович». Скорее, здесь сыграло роль прозвище, связанное с громогласностью или суровостью нрава.

Суффикс -юк в украинской ономастике традиционно указывал на «сына» или «потомка»: Пернюк — «сын Перня», где Пернь — сокращённая, усечённая форма от прозвища или имени. Усечение основ в народной речи — обычное дело: от «Пернач» легко могли образовать «Пернь», а затем и фамилию. Сравните с фамилиями Пернак, Пернатов — они той же группы, но с другими суффиксами.

В русских документах фамилия встречается редко, что подтверждает её западноукраинские корни. После переселений в XIX–XX веках носители могли оказаться в Сибири, на Дальнем Востоке или в центральной России. Сословная принадлежность предков, скорее всего, была крестьянской или казачьей — украинские фамилии на -юк редко носили дворяне. Точных данных о датах первого упоминания нет, но модель образования относит фамилию к XVII–XVIII векам, когда массово оформлялись украинские родовые имена.

Таким образом, Пернюк — фамилия с прозрачной словообразовательной схемой, но с основой, допускающей два-три равноправных толкования. Выбор между «оружейным» и «птичьим» корнем остаётся за семейным преданием или региональным контекстом, в котором жили предки.