Фамилия Першунин — одна из тех, где за простым суффиксом -ин скрывается неочевидная основа. Вопреки первому впечатлению, она не связана с именем Пётр (от которого пошли Петрунин, Петрушин). Её корень — Першун.

Першун — это прозвище, образованное от глагола «першить» (драть, саднить в горле). В русских говорах «першуном» могли называть человека с хриплым, сиплым голосом, того, кто постоянно кашляет или говорит с надрывом. Прозвище давали не в обиду, а как меткую бытовую характеристику — по заметной особенности речи или здоровью. В некоторых диалектах «першить» означало также «чесаться, зудеть», поэтому прозвище могло относиться к человеку беспокойному, ершистому.

Модель образования типична для северных и центральных областей России: основа Першун + патронимический суффикс -ин, который буквально означает «сын Першуна» или «из семьи Першуна». В отличие от фамилий на -ов, этот суффикс чаще встречался в Новгородской, Вологодской, Архангельской землях, а также в Сибири, куда переселенцы принесли свои говоры.

В документах фамилия фиксируется с XVII века. В переписных книгах Вологодского уезда 1678 года упоминается крестьянин Ивашко Першунов — вариант с суффиксом -ов, что говорит о колебаниях в оформлении фамилий на письме. Более поздние записи (XVIII–XIX века) встречаются в Олонецкой губернии и на Урале. География подтверждает: Першунины — в основном потомки государственных крестьян, не дворяне и не купцы.

Редкий случай — возможная связь с топонимом. В Тверской области есть деревня Першутино, но её корень другой (от имени Першута). С фамилией Першунин она не родственна, хотя внешнее сходство иногда вводит в заблуждение.

Известных носителей с громкой славой нет, но это не редкость для фамилии, которая осталась в крестьянской среде и не попала в списки знати. Её ценность — в прозрачной этимологии: она прямо указывает на прозвище предка, а не на абстрактное имя святого или географию.