Фамилия Паршунин — это классический пример русской «отцовской» фамилии, образованной от имени собственного. Корень здесь — Паршуня, ласкательная и обиходная форма, которую в старину использовали в быту вместо полного церковного имени. За этой короткой формой могут скрываться сразу три крестильных имени греческого происхождения: Парамон и Пармен (оба переводятся как «надёжный, верный») либо Парфений (от греческого «целомудренный, девственный»). Для повседневной речи такие длинные имена были неудобны, поэтому их сокращали до коротких и певучих вариантов, и Паршуня — один из них.

Сама фамилия построена по самой распространённой в России модели: к основе Паршун- добавили суффикс -ин. Такой суффикс указывал на принадлежность: Паршунин буквально означал «сын Паршуни». Если бы фамилия формировалась, скажем, на Украине или в Беларуси, мы бы скорее увидели форму Паршуненко или Паршунович, но на русском Севере и в центральных областях прижился именно вариант с -ин.

Интересно, что имя Паршуня не было редкостью в XV–XVII веках. В документах той поры встречаются крестьяне и посадские люди с таким именем, и именно от них пошло множество родственных фамилий: Паршуков, Паршуткин, Паршин. Фамилия Паршунин, таким образом, встаёт в один ряд с этими «детьми» одного корня, но сохраняет наиболее архаичную форму основы.

Кем были первые носители фамилии, сказать сложно: имя Паршуня не было привилегией какого-то одного сословия. Его могли носить и крестьянин, и ремесленник, и служилый человек. Фамилия закрепилась за потомками, когда в России начали массово оформлять наследственные прозвания, и с тех пор передавалась из поколения в поколение без изменений. Сегодня Паршунины встречаются по всей стране, но чаще всего — в Поволжье и на Урале, что косвенно указывает на пути миграции их предков в XVIII–XIX веках.