Петрутис — фамилия, которая сразу выдаёт литовское происхождение. Суффикс -ис (в мужском роде) или -ене/-уте (в женском) — типичная примета литовских фамилий, особенно в северо-западных регионах бывшей Российской империи. В отличие от русских фамилий на -ов/-ев, литовские фамилии на -ис часто сохраняют прямую связь с личным именем предка без дополнительных притяжательных суффиксов.

Основа Петр- — это то же имя Пётр, что и в русском языке, но в литовской огласовке. Получается, что Петрутис — это «Петрович» по-литовски, только образованное не от отчества, а напрямую от имени: сын Петра. В Литве такие фамилии (Петрутис, Петраускас, Петрайтис) встречаются часто, и все они восходят к христианскому имени апостола Петра, которое пришло в Литву вместе с крещением в конце XIV века.

Интересная деталь: если бы фамилия была образована в русской среде, она звучала бы как Петров или Петрухин. Форма Петрутис закрепилась именно в литовском языковом ареале, где ударение в таких фамилиях чаще всего падает на первый слог: Пе́трутис. Носители фамилии — потомки литовских крестьян или мещан, которые не получили дворянского герба, а просто взяли фамилию по отцу при массовом закреплении фамилий в XIX веке, когда Российская империя проводила ревизию населения в западных губерниях.

Спорных версий здесь нет: корень прозрачен, суффикс однозначно указывает на литовскую модель. Единственное, что может сбить с толку, — это личное имя Пётр, общее для многих народов. Но именно суффикс -ис и отсутствие русского окончания -ов не оставляют сомнений: перед вами литовская фамилия, а не русифицированный вариант.