Фамилия Пичушин образована от прозвища или нецерковного имени Пичуга. В русских говорах пичугой называли маленькую птицу, птаху, особенно птенца. Слово это звукоподражательное, от глагола «пищать» — так же, как и «писклёнок» или «пискун». Прозвище Пичуга могли дать невысокому, щуплому человеку, а иногда — обладателю тонкого, высокого голоса. Встречались и ласкательные варианты вроде Пичужка, Пичужонок.

В основе фамилии — суффикс -ин, который в русской ономастике указывает на принадлежность: «чей?» — «Пичугин сын». Со временем форма закрепилась в родительном падеже: от Пичуги — Пичугин. Однако в фамилии Пичушин мы видим другую, более редкую словообразовательную модель. Она могла возникнуть от формы Пичуша — это либо уменьшительно-ласкательный вариант от Пичуга, либо местное диалектное произношение того же корня. В некоторых говорах «пичуша» означало то же, что и «пичуга», но с другим суффиксом. Таким образом, Пичушин — это «сын Пичуши».

По географии фамилия встречается преимущественно в центральных и северных регионах России — в Вологодской, Архангельской, Кировской областях, а также на Урале. В этих местах слово «пичуга» было особенно употребительно. Встречаются и однокоренные фамилии — Пичугин, Пичужкин, Пичурин. Все они восходят к одному прозвищному гнезду, но Пичушин стоит особняком из-за суффикса -ш-, который реже встречается в русских фамилиях.

Сословной привязки у фамилии нет: Пичушины могли быть и крестьянами, и мещанами, и священниками. В документах XVII–XVIII веков встречаются отдельные упоминания — например, в переписных книгах Вятского края записаны крестьяне с такой фамилией. Но массовых исторических данных по известным носителям нет, что типично для фамилий, образованных от прозвищ из народной речи.