Фамилию Пичужина правильнее разбирать не с корня, а с суффикса. Окончание -а указывает на женскую форму, а основа Пичужин — на принадлежность мужу или отцу: «жена Пичужина» или «дочь Пичужина». Мужской вариант — Пичужин. Это типичная «патронимическая» (по отцу) или «маритонимическая» (по мужу) модель, где суффикс -ин присоединялся к основе прозвища или имени, оканчивающейся на -а или -я.

Основа Пичуж- восходит к диалектному слову «пичуга» — маленькая птица, птаха. В говорах пичугой называли не только воробья или синицу, но и любого мелкого певчего пернатого. Прозвище Пичуга давали либо человеку маленького роста и щуплого телосложения, либо обладателю звонкого, высокого голоса, либо тому, кто любил держать певчих птиц или сам был подвижным, вертлявым.

С точки зрения географии фамилия Пичужин не принадлежит к какой-то одной узкой области. Следы прозвища Пичуга встречаются в среднерусских говорах (Владимирская, Ярославская, Нижегородская губернии) и на севере (Архангельская, Вологодская). Однако по документам XVII–XVIII веков носители фамилии Пичужин фиксируются и в южных уездах — например, в Тамбовской и Рязанской землях, куда переселенцы принесли северное прозвище.

Интересная деталь: в некоторых говорах «пичужина» означала не птицу, а ямку, лунку, углубление в земле. Если это так, то прозвище могло относиться к человеку, жившему в низине или занимавшемуся копанием колодцев. Но эта версия менее распространена: ономастический словарь В. Никонова и работы Б. Унбегауна связывают фамилию именно с птичьим прозвищем.

В отличие от фамилий Птицын или Воробьёв, Пичужин — более редкий случай. Он не попал в массовые списки дворянских или купеческих родов, а бытовал в крестьянской и мещанской среде. В метрических книгах XIX века Пичужины встречаются как государственные крестьяне и однодворцы — потомки служилых людей, живших на южных рубежах. Так что предки современного носителя фамилии с равной вероятностью могли быть и северным крестьянином-охотником, и южным хлеборобом с прозвищем за рост или голос.