Фамилия Пидуков — редкий случай, когда основа почти наверняка связана с диалектным или профессиональным словом, а не с крестильным именем. Разберем её по косточкам.

В основе лежит прозвище Пидук. В русских говорах, особенно в южнорусских и на Урале, «пидук» или «пидух» — это невысокий, коренастый, плотный человек, иногда с оттенком «упрямый, крепкий как пенёк». Слово могло возникнуть от звукоподражательного «пидь» (короткий, резкий звук) или от глагола «пидюжить» — гнуть, жать, давить. Человек с таким прозвищем, скорее всего, был невысоким, но сильным, сбитым, возможно, с тяжелой походкой.

Суффикс -ов указывает на стандартную модель русской фамилии: «чей?» — сын Пидука. Фамилия образована не от названия профессии (как Кузнецов), а от личной характеристики. Это типичная «прозвищная» фамилия, каких много среди крестьянства: человека прозвали по внешности или нраву, и это закрепилось за его потомками.

Версия о связи с тюркским «пидук» (маленький, короткий) возможна, но маловероятна: слово хорошо вписывается в славянскую диалектную лексику. Встречаются однокоренные фамилии Пидуков, Пидухов, Пидушев — все они восходят к тому же корню, но с разными суффиксами, что подтверждает народное, а не книжное происхождение.

Географически фамилия редкая, встречается в основном в Курской, Воронежской областях и на юге Урала — там, где диалектное слово «пидук» было в ходу. Сословно предки — почти наверняка крестьяне или однодворцы, так как прозвище бытовое, не книжное и не дворянское.

Таким образом, Пидуков — это фамилия-характеристика. Ваш предок был невысоким, плотным, коренастым человеком, которого за эту особенность и прозвали.