Фамилия Пидюкова — женская форма фамилии Пидюков. Чтобы понять её происхождение, нужно разобрать мужской вариант, который строится по стандартной восточнославянской модели: основа + суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Пидюка). Значит, в основе лежит прозвище или неканоническое имя Пидюк.

Корень здесь тёмный, и единого мнения у этимологов нет. Самая вероятная версия связывает Пидюка с диалектным словом «пидька» — так в некоторых южнорусских и украинских говорах называли короткую палку, клюку или даже небольшой рычаг. Прозвище Пидюк могли дать человеку невысокого роста, хромому (опирающемуся на палку) или, напротив, мастеру, работающему с такими инструментами. Вторая гипотеза, менее распространённая, возводит основу к глаголу «пидеть» — в ряде говоров это означает «пищать» или «плакать тонким голосом». Тогда Пидюком могли прозвать капризного ребёнка или человека с высоким, «писклявым» голосом.

Важно не путать эту фамилию с похожими на слух, но другими по корню — например, с Педюковым (от имени Пётр в народной форме Педя) или Пидуковым (от «пидук» — в некоторых регионах так называли птенца). Пидюков — фамилия редкая, встречается в основном на юге России и в восточных областях Украины. В дореволюционных переписях она фиксировалась преимущественно у крестьян и мещан, что типично для фамилий, образованных от прозвищ: они закреплялись за простыми людьми, а не за дворянскими родами.

Таким образом, носительница фамилии Пидюкова может считать своим предком человека, которого в своей среде знали по характерной черте — либо внешней (невысокий, хромой), либо поведенческой (обидчивый, плаксивый). Точного значения сейчас не восстановить, но ясно, что фамилия образовалась в народной среде и несёт отпечаток живого, меткого языка.