Фамилия Пикушев не принадлежит к числу распространённых, и её происхождение не лежит на поверхности. В ней отчётливо читается суффикс -ев, который в русской ономастике обычно указывает на принадлежность («чей?» — сын Пикуша). Значит, основа фамилии — прозвище или мирское имя Пикуш.

Ключ к разгадке — слово «пикуша». В русских говорах, преимущественно северных и сибирских, так называли не только мелкую птицу, но и человека. Пикуша — это либо синица (от звукоподражательного «пи-пи»), либо, в переносном смысле, невысокий, юркий, суетливый человек. Сравните с однокоренными фамилиями Пикунов, Пикулин — все они восходят к глаголу «пикать» (издавать тонкий звук, пищать). Таким образом, родоначальник Пикушевых мог получить прозвище за свой голос, манеру говорить или за внешнее сходство с маленькой птахой.

Менее вероятна, но возможна версия, связывающая фамилию с диалектным словом «пикуша» в значении «остриё, колючка» (от «пика»). В этом случае прозвище могли дать человеку колкому, язвительному или, наоборот, обладающему каким-то острым предметом в хозяйстве. Однако фонетически форма «Пикушев» тяготеет к первой, «птичьей» версии, так как суффикс -уш- в русских прозвищах часто придаёт уменьшительно-ласкательный или пренебрежительный оттенок (ср. Ванюша, Петруша, но и воробушек). Здесь этот суффикс мог перейти из самого прозвища: Пикуш — это уже ласкательное от Пикуша.

С точки зрения географии, фамилия тяготеет к северным регионам России и Поволжью. Встречается она редко, что говорит о локальном происхождении — скорее всего, от одного прозвища, закрепившегося в конкретной местности. Сословно это почти наверняка крестьянская или мещанская фамилия: прозвища из мира природы и быта — самый частый источник русских фамилий низших сословий, оформившихся в XIX веке.