Фамилия Пильгинин — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не профессия, а географическое или этническое прозвище, причём с неочевидным корнем. Разберём её по косточкам.

Первое, что бросается в глаза — суффикс -ин. В русской фамильной модели он указывает на принадлежность: «чей?» — Пильгинин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Пильгиня. Обычно такие фамилии образовывались от имён или прозвищ, оканчивающихся на -а/-я (Гриша — Гришин, Фома — Фомин). Пильгиня — именно такое прозвище.

Корень Пильг- почти наверняка не славянский, а финно-угорский. В языках коми и удмуртов слово «пиль» (или «пыль») означает «ухо», а «пильгыны» — «ушастый», «тот, у кого большие или торчащие уши». В русских говорах северо-востока (Архангельская, Вятская, Пермская губернии) такое прозвище могли дать человеку с заметной внешней особенностью. Вторая, менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным «пильга» (петля, силок) — тогда прозвище мог получить охотник или мастер по изготовлению силков. Однако фонетика склоняет к первой версии: «Пильгиня» звучит как типичное для коми-пермяцкой среды ласкательное или уменьшительное образование от «пильгы» (ушастый).

Географически фамилия Пильгинин почти наверняка привязана к бассейну Камы и Вятки — территориям расселения коми-пермяков и удмуртов, где русское население веками жило в тесном контакте с финно-угорскими народами. В метрических книгах XIX века такие фамилии встречаются в Глазовском, Сарапульском, Оханском уездах. Социальный состав носителей — в основном государственные крестьяне, реже — однодворцы.

Таким образом, ваш предок по прозвищу Пильгиня — скорее всего, житель Прикамья или Вятки, получивший уличное имя за свою приметную внешность (уши), а его дети стали Пильгиниными. Это не дворянская и не купеческая фамилия, а типичная крестьянская, возникшая на стыке русской и финно-угорской языковых традиций.