Фамилия Пилюшкин образована от прозвища Пилюшка, которое, в свою очередь, восходит к глаголу «пиликать». Таким образом, прозвище Пилюшка, скорее всего, относится к так называемым «профессиональным» именованиям, содержащим указание на род деятельности предка. Вероятно, основатель рода Пилюшкиных занимался изготовлением различной домашней утвари из дерева. В таком случае можно предположить, что прозвище Пилюшка мог получить ученик, которому не удавалось игра на музыкальных инструментах, или человек, обладающий тонким голосом. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Пилюшка, со временем получил фамилию Пилюшкин.