Основой фамилии Пинаева послужило мирское имя Пинай. Фамилия Пинаева восходит к глаголу «пинать» - «толкать». Скорее всего, фамилия образована от некрестильного имени Пинай, которое дали ребенку, часто пинавшемуся ножками. Это нецерковное имя зафиксировано во Владимире в 1613 году. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Пинай, со временем получил фамилию Пинаева.