Фамилия Пипинев — редкий случай, когда основа прозвища неочевидна и заставляет заглянуть в диалектные словари. В отличие от большинства русских фамилий, образованных от крестильных имён или названий профессий, эта имеет в основе звукоподражательное или детское слово.

Скорее всего, в основе лежит глагол «пипинить» или существительное «пипинька». В северных и сибирских говорах «пипинить» означало «пищать, издавать тонкий звук», а «пипинька» — это и детская игрушка-свистулька, и просто что-то маленькое, писклявое. Прозвище Пипиня могли дать человеку с высоким голосом, либо тому, кто постоянно ныл или жаловался (пипинил). Вторая версия — происхождение от детского слова «пиписька» (в значении «маленький, несерьёзный»), но это менее вероятно для устойчивого прозвища взрослого человека.

Суффикс -ев указывает на стандартную русскую патронимическую модель: Пипинев — сын Пипиня. Фамилия закрепилась в форме притяжательного прилагательного, как и тысячи других (Иванов, Петров, Смирнов). Однако в отличие от них, основа здесь не имя, а прозвище, причём довольно редкое. В официальных документах XVI–XVII веков подобные прозвища почти не встречаются, что говорит о позднем или локальном характере фамилии.

Географически фамилия тяготеет к северо-востоку России. По данным современных телефонных справочников, большинство носителей живёт в Кировской области и Пермском крае — регионах, где сохранились древние архаичные говоры. Встречается также вариант написания Пипинёв (с буквой ё), который указывает на ударение на последний слог.

Однокоренных фамилий практически нет. Можно вспомнить разве что фамилию Пипин, которая встречается ещё реже. Это делает Пипинева уникальным случаем: фамилия не перешла из боярских родов и не связана с известными историческими персонажами. Её носители — потомки крестьян или ремесленников, чьё прозвище закрепилось за родом из-за какой-то заметной, пусть и негероической, особенности — писклявого голоса или привычки ныть.