Основой фамилии Плаксенко послужило мирское имя Плакса. Нецерковное имя Плакса восходит к слову «плакать». Плаксой родители нередко называли крикливого, беспокойного ребенка. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Плакса, со временем получил фамилию Плаксенко.