Фамилия Плотцын — редкий пример, когда основа и суффикс вступают в небольшое, но показательное противоречие. На первый взгляд, корень «плот-» наталкивает на мысль о ремесле: плотник, человек, работающий с деревом. Однако суффикс «-цын» (а не более привычный «-ин») указывает на иную модель образования. В русской ономастике суффикс «-цын» обычно присоединялся к основам, оканчивающимся на «-ц»: от прозвища или имени Курица — Курицын, от Птица — Птицын. Значит, в основе фамилии Плотцын лежит не слово «плотник», а некая форма, оканчивающаяся на «-ца»: скорее всего, прозвище Плотица или Плотца.

Самая вероятная версия связывает фамилию с названием рыбы — плотва. В старых говорах её называли «плотица» или «плотца». Прозвище Плотица могли дать человеку за внешнее сходство (небольшой, юркий, серебристый) или за пристрастие к этой рыбе — например, за частую ловлю или торговлю ею. От этого прозвища по правилу и возникла фамилия: Плотица → Плотцын. Вариант написания через «ы» (а не «и») — Плотцын вместо Плотицын — типичное явление для русских фамилий, где безударная гласная в суффиксе могла редуцироваться и закрепляться на письме по произношению.

Менее убедительна, но допустима версия о происхождении от слова «плот» (сплавное сооружение из брёвен). В этом случае прозвище Плотец или Плотовщик могло трансформироваться, но цепочка получилась бы сложнее: от «плот» с суффиксом «-ец» (Плотец) и далее с «-ын» — Плотцын. Однако прямое образование от «плотец» дало бы фамилию Плотцов, а не Плотцын. Поэтому рыбная версия выглядит естественнее и подтверждается типологией русских «рыбных» фамилий (Ершов, Окунев, Карасёв, Щукин).

Фамилия Плотцын — редкая, нечастотная. Встречается преимущественно в центральных и северных областях России, где плотва — обычная промысловая рыба. В дореволюционных записях её носители, скорее всего, относились к крестьянскому или мещанскому сословию, без связи с дворянством. Словообразовательная модель с суффиксом «-цын» — одна из старых, но менее продуктивных, что делает фамилию Плотцын характерным осколком народной антропонимии, где прозвище закрепилось за родом без изменений.