Фамилия Подболотов напрямую связана с нарицательным «болото» — «топкое место, обычно со стоячей водой», а также «вязкая почва, очень грязная дорога». От этого слова образовали прозвище, которое легло в основу фамилии. Но что именно оно означало — вопрос, в котором стоит разобраться.

Скорее всего, прозвище Подболот отражало особенности места жительства основателя рода. Человек, живший «под болотом», то есть в низине, у самой трясины или неподалеку от болотины, получал такое имя. Это самая простая и логичная версия: фамилии, указывающие на местоположение усадьбы или деревни, в русской ономастике встречаются сплошь и рядом.

Вторая версия — топонимическая. На территории России, Белоруссии, Польши и Украины существовало множество населенных пунктов с названиями Подболоты, Подболотье, Подболотово. Выходец из такого села вполне мог получить фамилию по названию своей малой родины. Учитывая, что такие ойконимы были широко распространены, эта гипотеза выглядит не менее убедительной, чем первая. Модель образования здесь та же, что и у множества других русских фамилий на -ов, но с редкой приставкой «под-», которая сразу выделяет фамилию из ряда однокоренных.

Однокоренные прозвища и фамилии неоднократно встречаются в исторических документах. Например, Иван Филиппович Болото Тургенев упоминается в середине XV века, а крестьянин Губа Болотов — в 1531 году в Переяславле. Существовала и дворянская фамилия Болотовых, известная с XVI века. Эти записи показывают, что основа «болото» была продуктивной для образования личных имен и прозвищ задолго до того, как закрепилась в фамилии. В этом ряду Подболотов — не исключение, а закономерное продолжение традиции.

Среди известных обладателей фамилии — Павел Алексеевич Подболотов, российский историк, доктор исторических наук, ректор Санкт-Петербургского государственного университета культуры и искусств с 1991 по 2009 год. Его биография подтверждает, что фамилия бытует в интеллектуальной среде, хотя, разумеется, никакой сословной или профессиональной привязки у нее нет — она встречалась и у крестьян, и у дворян, и у горожан.