Фамилию Подболоцкий стоит разбирать не с корня, а с суффикса. Окончание -ский указывает на её происхождение от географического названия. Это типичная модель для польской шляхты, западнорусских земель Речи Посполитой и русского духовенства. Фамилия означает «тот, кто родом из Подболоцка» или «тот, кто живёт под Болоцком».

В основе лежит топоним, который распадается на две части. Первая — приставка «под-», указывающая на положение рядом или ниже. Вторая — корень «болоц-». Это диалектный вариант слова «болото» (с чередованием оло/оло и упрощением в «болоцкий»). Таким образом, Подболоцк — это поселение, стоящее рядом с болотом или на болотистой почве.

Вероятнее всего, предок носителя фамилии получил её не от названия болота, а от конкретного населённого пункта. В Беларуси и на западе России существует несколько урочищ и бывших деревень с похожими названиями (Подболотье, Подболоцк). Человек, переселившийся из такого места, становился «Подболоцким» — то есть выходцем из Подболоцка.

Менее правдоподобна, но возможна версия, что фамилия образована напрямую от прозвища «Подболоцкий» — человека, жившего у болота. Однако суффикс -ский в русской народной традиции чаще закреплялся за дворянскими и семинарскими фамилиями, а не за крестьянскими прозвищами. Поэтому географическая версия выглядит убедительнее.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Подболоцкий стоит в одном ряду с Заболоцким (живущий за болотом) и Приболоцким (живущий при болоте). Разница в приставке давала точную привязку к местности — не за болотом, а именно под ним, то есть у его края или в низине. Социально фамилия могла принадлежать как мелкой шляхте, так и духовенству, получившему её при поступлении в семинарию по месту рождения или службы отца.