Фамилия Подлиняева — яркий пример того, как русская фамилия может хранить в себе не только прозвище, но и целый географический контекст. В её основе лежит слово «подлинь» или «подлинный», но не в современном значении «истинный», а в старом, диалектном. В говорах Русского Севера и Сибири «подлинь» — это длинная, тонкая жердь, которую привязывали к рыболовной сети снизу, чтобы та не всплывала и шла ровно по дну. Такой «подлинь» был важной частью снасти: без него сеть «играла» и не ловила. Человек, который делал эти жерди, устанавливал их или просто имел отношение к рыболовству, мог получить прозвище Подлинь, а его потомки стали Подлиняевыми.

Однако есть и вторая, более прозаичная версия. В некоторых областях «подлиной» называли низкорослого, худого или, наоборот, очень высокого и нескладного человека — то есть того, кто «подлиньше» (длиннее) обычного. Такое прозвище давали по внешности, и оно закреплялось за родом. Обе версии правдоподобны, но первая (рыболовная) встречается в ономастических исследованиях чаще, так как фамилия имеет чёткую «северную» привязку — её носители исторически концентрируются в Архангельской, Вологодской областях и в Поволжье, где рыбный промысел был основой жизни.

Суффикс «-ев» указывает на принадлежность: Подлиняев — сын Подлиня. В старых документах фамилия могла писаться через «а» (Подлиняев) или через «о» (Подлинеев), но современное написание закрепилось с «я» в корне. Интересно, что фамилия не получила широкого распространения за пределами северных регионов, поэтому её носители до сих пор часто могут проследить свои корни до конкретных деревень или сёл, где рыбачили их предки. Сословная принадлежность была преимущественно крестьянской или мещанской, без дворянских ветвей — это фамилия простого люда, жившего у воды.