Фамилия Подъяченкова — женская форма от Подъяченков, а та, в свою очередь, образована от прозвища или профессии дальнего предка. Основа здесь — «подъячий» (или «подьячий»). Так в допетровской и петровской Руси называли младшего канцелярского служащего, помощника дьяка. Подьячие писали указы, вели судебные и приказные книги, составляли челобитные. Это была низшая ступень бюрократии, но грамотный человек с пером в руке — фигура заметная, особенно в деревне, где умеющих читать и писать было наперечёт.

Словообразовательная модель стандартна для восточнославянских фамилий: суффикс -ов-/-ев- (с последующим -к- в женском варианте) указывает на принадлежность или родство: «сын подьячего». Мужская форма звучала бы как Подъяченков, где «-ен-» — результат исторического чередования в основе: подьячий → подьяченков (с беглой гласной). По сути, это патроним, застывший в виде фамилии.

Интересно, что в написании фамилии сохранился твёрдый знак (ъ) — архаичная черта. В дореволюционной орфографии «подьячий» писался именно через «ъ» (подъячий), так как приставка «под-» оканчивалась на согласную, а корень начинался с йотированной гласной. После реформы 1918 года твёрдый знак в таких позициях отменили, но фамилия, как семейное имя, могла сохранить старую графику. Встречаются и варианты без «ъ» — Подьяченков, но форма с твёрдым знаком — более редкая и исторически точная.

Географически фамилия тяготеет к бывшим центральным губерниям России — Московской, Тверской, Ярославской, Владимирской. В этих местах приказные избы и воеводские канцелярии были многочисленны, и подьячие составляли заметную прослойку посадского населения. Крепостными они, как правило, не были, а относились к служилым людям «по прибору» или к разночинцам.

Однокоренные фамилии — Подьячев, Подьячихин, Подьячий — встречаются реже. Все они отсылают к одному и тому же занятию, но Подъяченков стоит особняком из-за патронимического суффикса: он подчёркивает, что фамилию дали не самому подьячему, а его потомку.